Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms