Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms