Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM5Q71RC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms