Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBR3Q6ZT12 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms