Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms