Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms