Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms