Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms