Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms