Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC25A47Q6Q0C1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms