Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms