Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms