Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms