Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMYD5Q6GMV2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD5Q6GMV2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD5Q6GMV2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD5Q6GMV2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD5Q6GMV2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD5Q6GMV2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD5Q6GMV2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD5Q6GMV2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD5Q6GMV2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms