Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms