Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf57Q5W0N0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms