Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
CHIC1Q5VXU3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms