Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRNL1Q5VV63 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms