Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms