Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP188Q5SRE5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms