Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms