Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A12Q504Y0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms