Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC1Q4ZHG4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms