Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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