Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms