Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP100Q494V2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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