Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LETM2Q2VYF4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms