Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM1Q2NKQ1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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