Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms