Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIDA1Q1XH10 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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