Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms