Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRNQ16849 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTPRNQ16849 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRNQ16849 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRNQ16849 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRNQ16849 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRNQ16849 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRNQ16849 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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