Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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