Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGISQ16647 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGISQ16647 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms