Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
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STX1AQ16623 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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