Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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