Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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