Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms