Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VAMP3Q15836 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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VAMP3Q15836 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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VAMP3Q15836 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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VAMP3Q15836 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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VAMP3Q15836 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VAMP3Q15836 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VAMP3Q15836 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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