Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPTX1Q15818 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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