Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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