Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIP13Q15645 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
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