Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SEC23BQ15437 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SEC23BQ15437 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SEC23BQ15437 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SEC23BQ15437 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SEC23BQ15437 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SEC23BQ15437 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC23BQ15437 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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