Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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