Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NKX1-1Q15270 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NKX1-1Q15270 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms