Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms