Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KARSQ15046 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KARSQ15046 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KARSQ15046 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KARSQ15046 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KARSQ15046 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms