Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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