Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCA4Q14CN2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms