Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD4Q14CM0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD4Q14CM0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms